49万份全基因组提高低频变异填补精度

研究团队用UK Biobank的490319份全基因组测序数据构建新的基因型填补参考面板，并提供EagleImp与云端EagleImp-RAP工具。基因型填补是用参考人群推断研究样本中没有直接测到的变异，参考面板规模和多样性会影响疾病关联研究的发现能力。与包含133597人的TOPMed r3面板相比，新面板在除美洲混合人群外的全球超级人群以及26个1000 Genomes亚群中的25个降低了定相切换错误；对低至0.01%次要等位基因频率的变异，5个超级人群中的4个和12个亚群改善了平均绝对误差。重新分析欧洲COVID-19 GWAS还增加了显著位点并改善精细定位。UK Biobank参与者仍不能代表全球人口，部分美洲人群未占优；隐私、祖源偏差和外部队列复现仍是限制。